原子は「陽子、中性子、電子」というものから構成されていて、例えば水素原子であれば「陽子の数＝電子の数＝1個」と決まっていますが、
一方で中性子の個数については、0個の場合、1個の場合、2個の場合（人工的に合成するならもっといける）とがあります。
高校範囲で習う「同位体」というものです。

今回の問題に関して、
単体というのは同位体はごちゃ混ぜでもいいのですが、
「1種類の原子」と答えると「中性子の数まで同じ」という屁理屈を許してしまいます。

そのため、「中性子の数に関わらず、陽子と電子が1個の『水素』たち」みたいな意味合いでの、「元素」という答え方をしておいた方が無難になります。