What time is it now?　と、
文末に now をつけることで、「今何時？」として表すことがあります。

また、この問いに対する答え方は、「It is [時刻].」「It’s [時刻].」となります。
「９時ちょうど」であれば、nine o’clock というように「o’clock（ちょうど）」をつけることもあります。
 
 
（２）What time do you ～?
「What time do you ～?」の形で、「あなたは何時に～しますか？」という意味になります。

What time do you have lunch? – I always have lunch at twelve twenty.
「あなたは何時にお昼ご飯を食べますか？ー私はいつも１２：２０に食べます。」

また、「〇時にします」だけを答えるイメージで、「At ＋ [時刻].」と答える場合もあります。

なお、「you以外の主語でも」使うことができます。
What time does he go to school?　（彼は何時に学校に行きますか？）

ただし、その場合は「主語に対応した疑問文の形」にする必要があります。

＜その他の例文＞

What time is it now? – It’s six thirty.
「今何時ですか？ー６時半です。」

What time do you get up? – I usually get up at seven.
「あなたは何時に起きますか？ー私はたいてい７時に起きます。」

＜補足＞

「何時に～しますか？」と問われたときには、「頻度を表す副詞」がよく一緒に使われます。

・ always：いつも
・ofter：しばしば
・sometimes：ときどき
・usually：ふつう

などがこれにあたります。

＜まとめ＞

・「What time is it?」で「何時ですか？」という意味
・「What time do you ～？」で「何時に～しますか？」という意味
・「頻度を表す副詞」はふつう動詞の前におく