例えばアンモニア（NH₃）の場合、
N原子は、
(1) ３組の共有電子対（相手はすべてH原子）
(2) １組の非共有電子対
を持っている状態ですが、
この (2) の非共有電子対の所に H^＋ がやってきて、全体としてアンモニウムイオン（NH₄^＋）になるというのが配位結合の話です。

このとき、
(1) としての N-H 間の結合（が３つ）
(2) としての N-H 間の結合
とがあるわけですが、
アンモニウムイオンになった後で見れば、この計４つの結合は全く同じように見え、どれが元々の (1) 及び (2) なのか見分けがつかない、というものになっています。