一方で、将来したいことが特に決まっていなかったり、端的に学歴を確保しておきたい、ということであれば、大学受験に有利な方という判断をしてもらっても構わないと思います。
現に、大学に入ってから新しいことを見聞きして道が見えてきたり、就職となると（専門性が必要な職種を除けば）文系も理系も関係ないことがよくありますので、必ずしも冒頭のような「将来の夢からの逆算」でなくても構わないと思っています。
（よく理系の方が潰しが効くと言いますが、就活の際にはきちんと基礎力のテスト等も行われますので、文系だから軽視されるということはないと思って構わないです）

その作戦で行くなら、自分の得意科目を踏まえた上での判断で構いません。
また数学が得意なら、あえて数学が苦手な人の多い文系に行って点数を稼ぐという手もあります。

なお、本当にどっちでもいい感じだと、医学部人気が高い（成績優秀者が医学部志望に偏っている）ことを踏まえると、医学部以外の理系や、文系をターゲットにすれば、比較的優位に受験を戦うこともできると思います。